银行保函多用于国际贸易，国内会比较少，属于国际担保业务，而商业保函多用于国内国家。商业保函相对于银行保函要简单上许多，其不需要准备太多的资料，而且办理速度快，费用也比较低。商业保函的格式条款相对于会灵活一些，而银行保函的格式就会比较严谨，不能随意更改。
商业保函是以商业机构信用为担保，承担人是商业机构，属于商业信用。商业保函和银行保函具有同样的法律效益，不过商业保函比银行保函更便宜，办理手续更简便，免收保证金，只收取担保费，所以更多人会选择商业保函。
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见索即付保函建立的各个契约关系是互不相同的。担保人对受益人的责任只是由开出保函而产生的，其履行付款责任的惟一条件是在保函有效期内收到索款要求书和保函规定的并与保函条款相符的其他单据。担保人不是基础合同当事人，所以对合同的履行与否并不关心。