在净化车间厂房工程的设计过程中，应根据该工程是新建工程或者是旧厂房改造工程，并结合其具体的生产工艺、生产流程等要求确定其需要的洁净度、温湿度。再根据该工程的具体情况，同时还要考虑到生产厂家的经济承受能力，综合各种因素来确定采用何种净化方案，这样才可设计出一个能满足甲方生产使用要求、工程造价合理、经济节能实用的方案。
净化车间的良好的生产环境能保证生产的顺利进行，并能提高产品的产量。影响产品质量的主要因素之一是室内生产环境对产品质量的影响。如感光膜、集成电路、化学制剂、精密仪器、微型电机等，如果受到粉尘污染，就会降低其质量，甚至报废；在食品加工行业，微生物的存在会缩短产品的保质期，降低其质量。
一般情况下，在使用过程中，湿气和某些味道的存在会影响到整个车间净化工程的工作，因此我们在进行设计工作时，应认真地考虑到这些具体情况，通过正确的方法及时去排湿，同时也要适当的排热，只有当我们能将这两个方面的功能结合起来时，才能在应用过程中发挥作用。
洁净室建筑规划设计具备较强的综合性。它与普通的工业厂房建筑规划设计多种的是要主要解决为实现产品制造所标准的洁净环境，统筹安排好各专业技术在平面和空间布局上发生的矛盾;以适宜的工程造价，得到更好的空间与平面的综合性作用，并较好地符合产品制造所须要的洁净生产环境。这里特别要综合性处置好洁净室的建筑规划设计与洁净室工艺设计、空气净化设计中间互相协调问题，比如切合制造工艺流程、分配好人流与物流，洁净室的气流组织、建筑的气密性和建筑装饰的实用性等。